Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntnap5bQ0V8T8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntnap5bQ0V8T8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cntnap5bQ0V8T8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cntnap5bQ0V8T8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cntnap5bQ0V8T8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cntnap5bQ0V8T8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cntnap5bQ0V8T8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cntnap5bQ0V8T8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cntnap5bQ0V8T8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cntnap5bQ0V8T8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cntnap5bQ0V8T8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cntnap5bQ0V8T8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cntnap5bQ0V8T8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cntnap5bQ0V8T8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cntnap5bQ0V8T8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cntnap5bQ0V8T8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cntnap5bQ0V8T8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cntnap5bQ0V8T8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntnap5bQ0V8T8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntnap5bQ0V8T8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntnap5bQ0V8T8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntnap5bQ0V8T8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntnap5bQ0V8T8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntnap5bQ0V8T8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cntnap5bQ0V8T8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cntnap5bQ0V8T8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cntnap5bQ0V8T8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cntnap5bQ0V8T8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cntnap5bQ0V8T8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cntnap5bQ0V8T8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cntnap5bQ0V8T8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cntnap5bQ0V8T8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cntnap5bQ0V8T8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cntnap5bQ0V8T8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cntnap5bQ0V8T8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cntnap5bQ0V8T8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cntnap5bQ0V8T8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cntnap5bQ0V8T8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cntnap5bQ0V8T8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cntnap5bQ0V8T8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cntnap5bQ0V8T8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cntnap5bQ0V8T8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cntnap5bQ0V8T8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cntnap5bQ0V8T8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cntnap5bQ0V8T8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cntnap5bQ0V8T8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cntnap5bQ0V8T8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cntnap5bQ0V8T8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cntnap5bQ0V8T8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cntnap5bQ0V8T8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cntnap5bQ0V8T8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cntnap5bQ0V8T8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cntnap5bQ0V8T8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cntnap5bQ0V8T8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cntnap5bQ0V8T8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cntnap5bQ0V8T8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cntnap5bQ0V8T8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cntnap5bQ0V8T8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cntnap5bQ0V8T8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cntnap5bQ0V8T8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntnap5bQ0V8T8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntnap5bQ0V8T8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntnap5bQ0V8T8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cntnap5bQ0V8T8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cntnap5bQ0V8T8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cntnap5bQ0V8T8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cntnap5bQ0V8T8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cntnap5bQ0V8T8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cntnap5bQ0V8T8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cntnap5bQ0V8T8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cntnap5bQ0V8T8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cntnap5bQ0V8T8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cntnap5bQ0V8T8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cntnap5bQ0V8T8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cntnap5bQ0V8T8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cntnap5bQ0V8T8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cntnap5bQ0V8T8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cntnap5bQ0V8T8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cntnap5bQ0V8T8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cntnap5bQ0V8T8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cntnap5bQ0V8T8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cntnap5bQ0V8T8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cntnap5bQ0V8T8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cntnap5bQ0V8T8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cntnap5bQ0V8T8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cntnap5bQ0V8T8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms