Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab42Q0PD08 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab42Q0PD08 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab42Q0PD08 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab42Q0PD08 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab42Q0PD08 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab42Q0PD08 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab42Q0PD08 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab42Q0PD08 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab42Q0PD08 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab42Q0PD08 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab42Q0PD08 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab42Q0PD08 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab42Q0PD08 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab42Q0PD08 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab42Q0PD08 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab42Q0PD08 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab42Q0PD08 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab42Q0PD08 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab42Q0PD08 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab42Q0PD08 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab42Q0PD08 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab42Q0PD08 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab42Q0PD08 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab42Q0PD08 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab42Q0PD08 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab42Q0PD08 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab42Q0PD08 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab42Q0PD08 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab42Q0PD08 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab42Q0PD08 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab42Q0PD08 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab42Q0PD08 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab42Q0PD08 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab42Q0PD08 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab42Q0PD08 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab42Q0PD08 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab42Q0PD08 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab42Q0PD08 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab42Q0PD08 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab42Q0PD08 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab42Q0PD08 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab42Q0PD08 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab42Q0PD08 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab42Q0PD08 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab42Q0PD08 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab42Q0PD08 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab42Q0PD08 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab42Q0PD08 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab42Q0PD08 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab42Q0PD08 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab42Q0PD08 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab42Q0PD08 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rab42Q0PD08 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rab42Q0PD08 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rab42Q0PD08 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms