Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V2

Sobp, Sine oculis-binding protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SobpQ0P5V2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SobpQ0P5V2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SobpQ0P5V2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SobpQ0P5V2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SobpQ0P5V2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SobpQ0P5V2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SobpQ0P5V2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SobpQ0P5V2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SobpQ0P5V2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SobpQ0P5V2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SobpQ0P5V2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SobpQ0P5V2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SobpQ0P5V2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SobpQ0P5V2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SobpQ0P5V2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SobpQ0P5V2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SobpQ0P5V2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SobpQ0P5V2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SobpQ0P5V2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SobpQ0P5V2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SobpQ0P5V2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SobpQ0P5V2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SobpQ0P5V2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SobpQ0P5V2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SobpQ0P5V2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SobpQ0P5V2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SobpQ0P5V2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SobpQ0P5V2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SobpQ0P5V2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SobpQ0P5V2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SobpQ0P5V2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SobpQ0P5V2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SobpQ0P5V2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SobpQ0P5V2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SobpQ0P5V2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SobpQ0P5V2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SobpQ0P5V2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SobpQ0P5V2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SobpQ0P5V2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SobpQ0P5V2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SobpQ0P5V2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SobpQ0P5V2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SobpQ0P5V2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SobpQ0P5V2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SobpQ0P5V2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SobpQ0P5V2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SobpQ0P5V2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SobpQ0P5V2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SobpQ0P5V2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SobpQ0P5V2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SobpQ0P5V2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SobpQ0P5V2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SobpQ0P5V2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SobpQ0P5V2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SobpQ0P5V2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SobpQ0P5V2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SobpQ0P5V2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SobpQ0P5V2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SobpQ0P5V2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SobpQ0P5V2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SobpQ0P5V2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SobpQ0P5V2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SobpQ0P5V2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SobpQ0P5V2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SobpQ0P5V2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SobpQ0P5V2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SobpQ0P5V2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SobpQ0P5V2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SobpQ0P5V2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SobpQ0P5V2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SobpQ0P5V2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SobpQ0P5V2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SobpQ0P5V2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SobpQ0P5V2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SobpQ0P5V2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SobpQ0P5V2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SobpQ0P5V2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SobpQ0P5V2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SobpQ0P5V2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SobpQ0P5V2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SobpQ0P5V2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SobpQ0P5V2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SobpQ0P5V2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SobpQ0P5V2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SobpQ0P5V2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SobpQ0P5V2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SobpQ0P5V2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SobpQ0P5V2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SobpQ0P5V2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SobpQ0P5V2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SobpQ0P5V2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SobpQ0P5V2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SobpQ0P5V2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SobpQ0P5V2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SobpQ0P5V2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SobpQ0P5V2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SobpQ0P5V2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SobpQ0P5V2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SobpQ0P5V2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SobpQ0P5V2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms