Protein–RNA interactions for Protein: Q09324

Gcnt1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt1Q09324 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gcnt1Q09324 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gcnt1Q09324 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gcnt1Q09324 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Gcnt1Q09324 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gcnt1Q09324 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gcnt1Q09324 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gcnt1Q09324 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gcnt1Q09324 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gcnt1Q09324 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gcnt1Q09324 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gcnt1Q09324 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gcnt1Q09324 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gcnt1Q09324 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gcnt1Q09324 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gcnt1Q09324 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gcnt1Q09324 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gcnt1Q09324 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gcnt1Q09324 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gcnt1Q09324 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gcnt1Q09324 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gcnt1Q09324 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gcnt1Q09324 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gcnt1Q09324 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gcnt1Q09324 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gcnt1Q09324 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gcnt1Q09324 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gcnt1Q09324 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gcnt1Q09324 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gcnt1Q09324 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gcnt1Q09324 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gcnt1Q09324 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gcnt1Q09324 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gcnt1Q09324 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gcnt1Q09324 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gcnt1Q09324 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gcnt1Q09324 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gcnt1Q09324 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gcnt1Q09324 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gcnt1Q09324 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gcnt1Q09324 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gcnt1Q09324 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gcnt1Q09324 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gcnt1Q09324 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gcnt1Q09324 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gcnt1Q09324 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Gcnt1Q09324 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gcnt1Q09324 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gcnt1Q09324 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gcnt1Q09324 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Gcnt1Q09324 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gcnt1Q09324 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gcnt1Q09324 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gcnt1Q09324 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gcnt1Q09324 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gcnt1Q09324 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gcnt1Q09324 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gcnt1Q09324 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gcnt1Q09324 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gcnt1Q09324 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gcnt1Q09324 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gcnt1Q09324 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gcnt1Q09324 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gcnt1Q09324 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gcnt1Q09324 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gcnt1Q09324 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gcnt1Q09324 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gcnt1Q09324 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gcnt1Q09324 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gcnt1Q09324 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gcnt1Q09324 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gcnt1Q09324 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gcnt1Q09324 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gcnt1Q09324 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gcnt1Q09324 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gcnt1Q09324 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gcnt1Q09324 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gcnt1Q09324 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gcnt1Q09324 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gcnt1Q09324 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gcnt1Q09324 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gcnt1Q09324 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gcnt1Q09324 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gcnt1Q09324 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gcnt1Q09324 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gcnt1Q09324 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Gcnt1Q09324 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gcnt1Q09324 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gcnt1Q09324 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gcnt1Q09324 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gcnt1Q09324 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gcnt1Q09324 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gcnt1Q09324 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gcnt1Q09324 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gcnt1Q09324 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gcnt1Q09324 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gcnt1Q09324 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gcnt1Q09324 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gcnt1Q09324 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gcnt1Q09324 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms