Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gata4Q08369 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms