Protein–RNA interactions for Protein: Q08297

Rad51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51Q08297 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rad51Q08297 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rad51Q08297 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rad51Q08297 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rad51Q08297 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rad51Q08297 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rad51Q08297 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rad51Q08297 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rad51Q08297 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rad51Q08297 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rad51Q08297 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rad51Q08297 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rad51Q08297 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rad51Q08297 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Rad51Q08297 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rad51Q08297 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rad51Q08297 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rad51Q08297 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rad51Q08297 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rad51Q08297 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rad51Q08297 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rad51Q08297 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rad51Q08297 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rad51Q08297 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rad51Q08297 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rad51Q08297 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rad51Q08297 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rad51Q08297 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rad51Q08297 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rad51Q08297 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rad51Q08297 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rad51Q08297 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rad51Q08297 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rad51Q08297 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rad51Q08297 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rad51Q08297 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rad51Q08297 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rad51Q08297 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rad51Q08297 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rad51Q08297 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rad51Q08297 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rad51Q08297 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rad51Q08297 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rad51Q08297 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rad51Q08297 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rad51Q08297 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rad51Q08297 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rad51Q08297 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rad51Q08297 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rad51Q08297 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms