Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ebf1Q07802 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ebf1Q07802 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ebf1Q07802 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ebf1Q07802 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ebf1Q07802 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ebf1Q07802 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ebf1Q07802 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ebf1Q07802 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ebf1Q07802 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ebf1Q07802 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ebf1Q07802 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ebf1Q07802 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ebf1Q07802 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ebf1Q07802 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ebf1Q07802 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ebf1Q07802 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ebf1Q07802 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ebf1Q07802 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ebf1Q07802 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ebf1Q07802 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ebf1Q07802 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ebf1Q07802 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ebf1Q07802 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ebf1Q07802 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ebf1Q07802 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ebf1Q07802 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ebf1Q07802 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ebf1Q07802 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ebf1Q07802 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ebf1Q07802 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ebf1Q07802 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ebf1Q07802 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ebf1Q07802 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ebf1Q07802 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ebf1Q07802 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ebf1Q07802 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ebf1Q07802 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ebf1Q07802 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ebf1Q07802 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ebf1Q07802 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ebf1Q07802 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ebf1Q07802 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ebf1Q07802 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ebf1Q07802 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ebf1Q07802 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ebf1Q07802 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ebf1Q07802 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ebf1Q07802 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ebf1Q07802 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ebf1Q07802 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ebf1Q07802 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ebf1Q07802 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ebf1Q07802 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ebf1Q07802 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ebf1Q07802 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ebf1Q07802 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ebf1Q07802 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ebf1Q07802 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ebf1Q07802 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ebf1Q07802 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ebf1Q07802 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ebf1Q07802 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ebf1Q07802 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ebf1Q07802 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ebf1Q07802 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ebf1Q07802 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ebf1Q07802 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ebf1Q07802 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ebf1Q07802 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ebf1Q07802 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ebf1Q07802 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ebf1Q07802 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ebf1Q07802 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ebf1Q07802 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ebf1Q07802 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ebf1Q07802 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ebf1Q07802 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ebf1Q07802 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ebf1Q07802 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ebf1Q07802 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ebf1Q07802 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ebf1Q07802 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ebf1Q07802 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ebf1Q07802 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ebf1Q07802 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ebf1Q07802 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ebf1Q07802 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ebf1Q07802 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ebf1Q07802 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ebf1Q07802 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ebf1Q07802 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ebf1Q07802 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ebf1Q07802 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ebf1Q07802 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ebf1Q07802 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ebf1Q07802 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ebf1Q07802 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ebf1Q07802 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ebf1Q07802 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms