Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntn3Q07409 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cntn3Q07409 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cntn3Q07409 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cntn3Q07409 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cntn3Q07409 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cntn3Q07409 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cntn3Q07409 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntn3Q07409 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntn3Q07409 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntn3Q07409 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntn3Q07409 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cntn3Q07409 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntn3Q07409 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntn3Q07409 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntn3Q07409 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntn3Q07409 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntn3Q07409 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cntn3Q07409 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntn3Q07409 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntn3Q07409 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntn3Q07409 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntn3Q07409 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntn3Q07409 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntn3Q07409 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntn3Q07409 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntn3Q07409 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cntn3Q07409 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntn3Q07409 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntn3Q07409 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntn3Q07409 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntn3Q07409 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntn3Q07409 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cntn3Q07409 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntn3Q07409 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntn3Q07409 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntn3Q07409 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntn3Q07409 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntn3Q07409 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntn3Q07409 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntn3Q07409 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntn3Q07409 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntn3Q07409 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntn3Q07409 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntn3Q07409 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntn3Q07409 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntn3Q07409 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntn3Q07409 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntn3Q07409 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntn3Q07409 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntn3Q07409 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms