Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Siah1bQ06985 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Siah1bQ06985 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Siah1bQ06985 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Siah1bQ06985 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Siah1bQ06985 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Siah1bQ06985 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Siah1bQ06985 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Siah1bQ06985 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Siah1bQ06985 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Siah1bQ06985 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Siah1bQ06985 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Siah1bQ06985 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Siah1bQ06985 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Siah1bQ06985 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Siah1bQ06985 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Siah1bQ06985 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Siah1bQ06985 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Siah1bQ06985 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Siah1bQ06985 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Siah1bQ06985 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Siah1bQ06985 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Siah1bQ06985 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Siah1bQ06985 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Siah1bQ06985 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Siah1bQ06985 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Siah1bQ06985 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Siah1bQ06985 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Siah1bQ06985 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Siah1bQ06985 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Siah1bQ06985 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Siah1bQ06985 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Siah1bQ06985 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Siah1bQ06985 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Siah1bQ06985 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Siah1bQ06985 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Siah1bQ06985 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Siah1bQ06985 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Siah1bQ06985 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Siah1bQ06985 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Siah1bQ06985 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Siah1bQ06985 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Siah1bQ06985 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Siah1bQ06985 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Siah1bQ06985 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Siah1bQ06985 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Siah1bQ06985 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Siah1bQ06985 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Siah1bQ06985 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Siah1bQ06985 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Siah1bQ06985 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Siah1bQ06985 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Siah1bQ06985 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Siah1bQ06985 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Siah1bQ06985 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Siah1bQ06985 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Siah1bQ06985 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Siah1bQ06985 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Siah1bQ06985 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Siah1bQ06985 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Siah1bQ06985 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Siah1bQ06985 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Siah1bQ06985 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Siah1bQ06985 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Siah1bQ06985 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Siah1bQ06985 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Siah1bQ06985 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Siah1bQ06985 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Siah1bQ06985 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Siah1bQ06985 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Siah1bQ06985 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Siah1bQ06985 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Siah1bQ06985 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Siah1bQ06985 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Siah1bQ06985 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Siah1bQ06985 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Siah1bQ06985 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Siah1bQ06985 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Siah1bQ06985 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Siah1bQ06985 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Siah1bQ06985 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Siah1bQ06985 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Siah1bQ06985 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Siah1bQ06985 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Siah1bQ06985 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Siah1bQ06985 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Siah1bQ06985 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Siah1bQ06985 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Siah1bQ06985 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Siah1bQ06985 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Siah1bQ06985 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Siah1bQ06985 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Siah1bQ06985 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Siah1bQ06985 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Siah1bQ06985 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Siah1bQ06985 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Siah1bQ06985 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Siah1bQ06985 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Siah1bQ06985 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Siah1bQ06985 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms