Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrstQ06666 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrstQ06666 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrstQ06666 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SrstQ06666 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SrstQ06666 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SrstQ06666 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SrstQ06666 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrstQ06666 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrstQ06666 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrstQ06666 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrstQ06666 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrstQ06666 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrstQ06666 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrstQ06666 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SrstQ06666 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrstQ06666 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrstQ06666 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrstQ06666 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrstQ06666 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrstQ06666 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrstQ06666 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrstQ06666 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrstQ06666 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SrstQ06666 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrstQ06666 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrstQ06666 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrstQ06666 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrstQ06666 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrstQ06666 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrstQ06666 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrstQ06666 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrstQ06666 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrstQ06666 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrstQ06666 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrstQ06666 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrstQ06666 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SrstQ06666 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrstQ06666 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrstQ06666 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrstQ06666 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrstQ06666 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrstQ06666 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrstQ06666 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SrstQ06666 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms