Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atf4Q06507 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atf4Q06507 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atf4Q06507 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atf4Q06507 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atf4Q06507 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atf4Q06507 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf4Q06507 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf4Q06507 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf4Q06507 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf4Q06507 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf4Q06507 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf4Q06507 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf4Q06507 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf4Q06507 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf4Q06507 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf4Q06507 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf4Q06507 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atf4Q06507 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atf4Q06507 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atf4Q06507 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atf4Q06507 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atf4Q06507 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atf4Q06507 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atf4Q06507 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms