Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk18Q04899 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk18Q04899 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk18Q04899 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk18Q04899 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk18Q04899 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk18Q04899 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk18Q04899 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk18Q04899 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk18Q04899 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk18Q04899 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk18Q04899 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk18Q04899 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk18Q04899 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk18Q04899 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk18Q04899 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk18Q04899 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk18Q04899 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk18Q04899 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk18Q04899 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk18Q04899 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk18Q04899 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk18Q04899 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk18Q04899 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdk18Q04899 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdk18Q04899 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdk18Q04899 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdk18Q04899 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdk18Q04899 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdk18Q04899 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk18Q04899 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk18Q04899 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk18Q04899 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk18Q04899 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk18Q04899 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk18Q04899 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk18Q04899 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk18Q04899 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk18Q04899 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cdk18Q04899 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk18Q04899 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk18Q04899 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk18Q04899 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk18Q04899 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk18Q04899 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk18Q04899 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk18Q04899 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk18Q04899 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms