Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sox12Q04890 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sox12Q04890 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sox12Q04890 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sox12Q04890 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sox12Q04890 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sox12Q04890 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sox12Q04890 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sox12Q04890 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sox12Q04890 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sox12Q04890 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sox12Q04890 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sox12Q04890 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sox12Q04890 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sox12Q04890 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sox12Q04890 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Sox12Q04890 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Sox12Q04890 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sox12Q04890 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sox12Q04890 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sox12Q04890 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sox12Q04890 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sox12Q04890 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sox12Q04890 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sox12Q04890 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sox12Q04890 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sox12Q04890 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sox12Q04890 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sox12Q04890 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sox12Q04890 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sox12Q04890 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Sox12Q04890 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sox12Q04890 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sox12Q04890 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Sox12Q04890 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sox12Q04890 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sox12Q04890 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sox12Q04890 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Sox12Q04890 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Sox12Q04890 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Sox12Q04890 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Sox12Q04890 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sox12Q04890 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sox12Q04890 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sox12Q04890 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Sox12Q04890 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Sox12Q04890 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sox12Q04890 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sox12Q04890 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sox12Q04890 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sox12Q04890 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sox12Q04890 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sox12Q04890 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sox12Q04890 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Sox12Q04890 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Sox12Q04890 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Sox12Q04890 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Sox12Q04890 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sox12Q04890 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sox12Q04890 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sox12Q04890 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sox12Q04890 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sox12Q04890 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sox12Q04890 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sox12Q04890 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sox12Q04890 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sox12Q04890 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sox12Q04890 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sox12Q04890 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sox12Q04890 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sox12Q04890 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sox12Q04890 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sox12Q04890 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sox12Q04890 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sox12Q04890 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sox12Q04890 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sox12Q04890 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sox12Q04890 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sox12Q04890 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sox12Q04890 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sox12Q04890 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sox12Q04890 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sox12Q04890 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sox12Q04890 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Sox12Q04890 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sox12Q04890 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sox12Q04890 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sox12Q04890 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sox12Q04890 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sox12Q04890 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sox12Q04890 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sox12Q04890 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sox12Q04890 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sox12Q04890 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sox12Q04890 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sox12Q04890 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sox12Q04890 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sox12Q04890 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sox12Q04890 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sox12Q04890 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms