Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox9Q04887 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox9Q04887 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox9Q04887 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox9Q04887 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox9Q04887 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox9Q04887 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox9Q04887 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox9Q04887 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox9Q04887 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox9Q04887 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Sox9Q04887 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Sox9Q04887 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sox9Q04887 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sox9Q04887 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sox9Q04887 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox9Q04887 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox9Q04887 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox9Q04887 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox9Q04887 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox9Q04887 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox9Q04887 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox9Q04887 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox9Q04887 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox9Q04887 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox9Q04887 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox9Q04887 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox9Q04887 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox9Q04887 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox9Q04887 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox9Q04887 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox9Q04887 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox9Q04887 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox9Q04887 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox9Q04887 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox9Q04887 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox9Q04887 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sox9Q04887 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sox9Q04887 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sox9Q04887 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sox9Q04887 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sox9Q04887 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sox9Q04887 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sox9Q04887 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sox9Q04887 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sox9Q04887 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sox9Q04887 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sox9Q04887 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sox9Q04887 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sox9Q04887 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sox9Q04887 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sox9Q04887 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox9Q04887 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox9Q04887 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox9Q04887 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox9Q04887 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox9Q04887 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox9Q04887 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox9Q04887 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox9Q04887 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox9Q04887 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox9Q04887 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sox9Q04887 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sox9Q04887 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sox9Q04887 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sox9Q04887 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox9Q04887 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox9Q04887 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox9Q04887 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox9Q04887 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox9Q04887 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox9Q04887 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox9Q04887 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox9Q04887 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox9Q04887 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox9Q04887 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox9Q04887 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox9Q04887 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox9Q04887 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox9Q04887 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox9Q04887 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms