Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk16Q04735 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms