Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcnd1Q03719 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcnd1Q03719 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcnd1Q03719 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcnd1Q03719 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcnd1Q03719 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcnd1Q03719 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnd1Q03719 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnd1Q03719 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnd1Q03719 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnd1Q03719 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnd1Q03719 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnd1Q03719 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnd1Q03719 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnd1Q03719 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnd1Q03719 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnd1Q03719 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnd1Q03719 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnd1Q03719 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnd1Q03719 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcnd1Q03719 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcnd1Q03719 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcnd1Q03719 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcnd1Q03719 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcnd1Q03719 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcnd1Q03719 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcnd1Q03719 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcnd1Q03719 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcnd1Q03719 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcnd1Q03719 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcnd1Q03719 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcnd1Q03719 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcnd1Q03719 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcnd1Q03719 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcnd1Q03719 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcnd1Q03719 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcnd1Q03719 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcnd1Q03719 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcnd1Q03719 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcnd1Q03719 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcnd1Q03719 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcnd1Q03719 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcnd1Q03719 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcnd1Q03719 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcnd1Q03719 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcnd1Q03719 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcnd1Q03719 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcnd1Q03719 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcnd1Q03719 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcnd1Q03719 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcnd1Q03719 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcnd1Q03719 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcnd1Q03719 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcnd1Q03719 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcnd1Q03719 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcnd1Q03719 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcnd1Q03719 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms