Protein–RNA interactions for Protein: Q03147

Cdk7, Cyclin-dependent kinase 7, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk7Q03147 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk7Q03147 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk7Q03147 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk7Q03147 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk7Q03147 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk7Q03147 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk7Q03147 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk7Q03147 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk7Q03147 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk7Q03147 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk7Q03147 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk7Q03147 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk7Q03147 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk7Q03147 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk7Q03147 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk7Q03147 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk7Q03147 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk7Q03147 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk7Q03147 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk7Q03147 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk7Q03147 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk7Q03147 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk7Q03147 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk7Q03147 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk7Q03147 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk7Q03147 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk7Q03147 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk7Q03147 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk7Q03147 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk7Q03147 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk7Q03147 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk7Q03147 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk7Q03147 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk7Q03147 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk7Q03147 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk7Q03147 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk7Q03147 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk7Q03147 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk7Q03147 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk7Q03147 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk7Q03147 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk7Q03147 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk7Q03147 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk7Q03147 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk7Q03147 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk7Q03147 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk7Q03147 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk7Q03147 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk7Q03147 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk7Q03147 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk7Q03147 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk7Q03147 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk7Q03147 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk7Q03147 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk7Q03147 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk7Q03147 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk7Q03147 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk7Q03147 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk7Q03147 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk7Q03147 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk7Q03147 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk7Q03147 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk7Q03147 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk7Q03147 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk7Q03147 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk7Q03147 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk7Q03147 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk7Q03147 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk7Q03147 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk7Q03147 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk7Q03147 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk7Q03147 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk7Q03147 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk7Q03147 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk7Q03147 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk7Q03147 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk7Q03147 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cdk7Q03147 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cdk7Q03147 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk7Q03147 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk7Q03147 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk7Q03147 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk7Q03147 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk7Q03147 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk7Q03147 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk7Q03147 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms