Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VcpQ01853 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VcpQ01853 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VcpQ01853 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VcpQ01853 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VcpQ01853 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VcpQ01853 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VcpQ01853 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VcpQ01853 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VcpQ01853 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VcpQ01853 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VcpQ01853 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VcpQ01853 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VcpQ01853 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VcpQ01853 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VcpQ01853 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VcpQ01853 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VcpQ01853 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VcpQ01853 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VcpQ01853 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VcpQ01853 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VcpQ01853 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VcpQ01853 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VcpQ01853 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VcpQ01853 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VcpQ01853 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VcpQ01853 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VcpQ01853 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VcpQ01853 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VcpQ01853 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VcpQ01853 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VcpQ01853 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VcpQ01853 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VcpQ01853 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VcpQ01853 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VcpQ01853 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VcpQ01853 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VcpQ01853 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VcpQ01853 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VcpQ01853 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VcpQ01853 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VcpQ01853 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VcpQ01853 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VcpQ01853 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VcpQ01853 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VcpQ01853 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VcpQ01853 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VcpQ01853 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VcpQ01853 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VcpQ01853 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VcpQ01853 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VcpQ01853 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VcpQ01853 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VcpQ01853 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VcpQ01853 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VcpQ01853 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VcpQ01853 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VcpQ01853 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VcpQ01853 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VcpQ01853 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VcpQ01853 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VcpQ01853 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VcpQ01853 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VcpQ01853 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VcpQ01853 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VcpQ01853 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VcpQ01853 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VcpQ01853 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VcpQ01853 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VcpQ01853 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VcpQ01853 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VcpQ01853 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VcpQ01853 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VcpQ01853 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VcpQ01853 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VcpQ01853 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VcpQ01853 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VcpQ01853 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VcpQ01853 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VcpQ01853 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VcpQ01853 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms