Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Hoxd1Q01822 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxd1Q01822 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxd1Q01822 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxd1Q01822 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd1Q01822 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd1Q01822 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd1Q01822 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd1Q01822 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms