Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cacna1cQ01815 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cacna1cQ01815 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cacna1cQ01815 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cacna1cQ01815 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cacna1cQ01815 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cacna1cQ01815 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cacna1cQ01815 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cacna1cQ01815 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.9 ms