Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sec23aQ01405 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sec23aQ01405 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sec23aQ01405 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sec23aQ01405 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sec23aQ01405 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sec23aQ01405 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sec23aQ01405 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sec23aQ01405 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sec23aQ01405 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sec23aQ01405 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sec23aQ01405 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sec23aQ01405 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Sec23aQ01405 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sec23aQ01405 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sec23aQ01405 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sec23aQ01405 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Sec23aQ01405 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sec23aQ01405 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sec23aQ01405 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sec23aQ01405 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Sec23aQ01405 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sec23aQ01405 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sec23aQ01405 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sec23aQ01405 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sec23aQ01405 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sec23aQ01405 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sec23aQ01405 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sec23aQ01405 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sec23aQ01405 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sec23aQ01405 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sec23aQ01405 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sec23aQ01405 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sec23aQ01405 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sec23aQ01405 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sec23aQ01405 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sec23aQ01405 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sec23aQ01405 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sec23aQ01405 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sec23aQ01405 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Sec23aQ01405 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sec23aQ01405 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sec23aQ01405 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sec23aQ01405 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sec23aQ01405 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sec23aQ01405 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sec23aQ01405 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sec23aQ01405 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sec23aQ01405 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sec23aQ01405 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sec23aQ01405 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sec23aQ01405 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sec23aQ01405 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sec23aQ01405 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sec23aQ01405 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sec23aQ01405 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sec23aQ01405 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sec23aQ01405 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sec23aQ01405 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sec23aQ01405 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sec23aQ01405 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sec23aQ01405 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Sec23aQ01405 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sec23aQ01405 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sec23aQ01405 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sec23aQ01405 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sec23aQ01405 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sec23aQ01405 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sec23aQ01405 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sec23aQ01405 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sec23aQ01405 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sec23aQ01405 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sec23aQ01405 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sec23aQ01405 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sec23aQ01405 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sec23aQ01405 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Sec23aQ01405 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sec23aQ01405 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sec23aQ01405 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sec23aQ01405 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sec23aQ01405 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sec23aQ01405 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sec23aQ01405 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sec23aQ01405 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sec23aQ01405 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sec23aQ01405 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sec23aQ01405 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sec23aQ01405 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sec23aQ01405 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sec23aQ01405 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sec23aQ01405 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sec23aQ01405 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sec23aQ01405 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sec23aQ01405 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sec23aQ01405 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sec23aQ01405 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sec23aQ01405 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sec23aQ01405 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sec23aQ01405 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sec23aQ01405 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms