Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Top2aQ01320 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Top2aQ01320 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Top2aQ01320 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Top2aQ01320 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Top2aQ01320 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Top2aQ01320 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Top2aQ01320 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Top2aQ01320 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Top2aQ01320 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Top2aQ01320 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Top2aQ01320 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Top2aQ01320 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Top2aQ01320 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Top2aQ01320 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Top2aQ01320 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Top2aQ01320 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
Top2aQ01320 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Top2aQ01320 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Top2aQ01320 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Top2aQ01320 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Top2aQ01320 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Top2aQ01320 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Top2aQ01320 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Top2aQ01320 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Top2aQ01320 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Top2aQ01320 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
Top2aQ01320 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Top2aQ01320 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Top2aQ01320 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Top2aQ01320 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
Top2aQ01320 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Top2aQ01320 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Top2aQ01320 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
Top2aQ01320 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Top2aQ01320 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Top2aQ01320 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Top2aQ01320 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Top2aQ01320 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Top2aQ01320 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Top2aQ01320 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Top2aQ01320 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Top2aQ01320 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Top2aQ01320 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Top2aQ01320 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Top2aQ01320 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Top2aQ01320 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Top2aQ01320 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Top2aQ01320 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Top2aQ01320 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Top2aQ01320 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Top2aQ01320 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Top2aQ01320 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Top2aQ01320 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC35.63■■■■□ 3.3
Top2aQ01320 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Top2aQ01320 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Top2aQ01320 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Top2aQ01320 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Top2aQ01320 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Top2aQ01320 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Top2aQ01320 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Top2aQ01320 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Top2aQ01320 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Top2aQ01320 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Top2aQ01320 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Top2aQ01320 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Top2aQ01320 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
Top2aQ01320 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Top2aQ01320 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
Top2aQ01320 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Top2aQ01320 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Top2aQ01320 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Top2aQ01320 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
Top2aQ01320 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Top2aQ01320 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Top2aQ01320 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Top2aQ01320 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Top2aQ01320 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Top2aQ01320 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Top2aQ01320 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Top2aQ01320 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Top2aQ01320 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Top2aQ01320 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Top2aQ01320 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Top2aQ01320 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Top2aQ01320 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Top2aQ01320 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Top2aQ01320 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Top2aQ01320 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Top2aQ01320 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Top2aQ01320 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Top2aQ01320 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Top2aQ01320 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Top2aQ01320 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Top2aQ01320 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Top2aQ01320 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Top2aQ01320 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Top2aQ01320 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Top2aQ01320 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Top2aQ01320 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms