Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gjb2Q00977 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gjb2Q00977 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gjb2Q00977 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gjb2Q00977 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gjb2Q00977 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gjb2Q00977 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gjb2Q00977 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gjb2Q00977 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gjb2Q00977 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gjb2Q00977 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gjb2Q00977 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gjb2Q00977 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gjb2Q00977 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gjb2Q00977 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gjb2Q00977 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gjb2Q00977 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gjb2Q00977 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gjb2Q00977 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gjb2Q00977 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gjb2Q00977 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gjb2Q00977 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gjb2Q00977 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gjb2Q00977 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gjb2Q00977 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gjb2Q00977 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gjb2Q00977 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gjb2Q00977 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gjb2Q00977 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Gjb2Q00977 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Gjb2Q00977 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gjb2Q00977 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gjb2Q00977 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gjb2Q00977 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gjb2Q00977 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gjb2Q00977 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gjb2Q00977 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gjb2Q00977 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gjb2Q00977 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gjb2Q00977 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gjb2Q00977 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gjb2Q00977 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gjb2Q00977 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gjb2Q00977 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gjb2Q00977 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gjb2Q00977 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gjb2Q00977 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gjb2Q00977 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gjb2Q00977 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gjb2Q00977 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Gjb2Q00977 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Gjb2Q00977 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gjb2Q00977 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gjb2Q00977 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gjb2Q00977 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gjb2Q00977 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gjb2Q00977 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gjb2Q00977 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gjb2Q00977 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gjb2Q00977 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gjb2Q00977 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gjb2Q00977 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gjb2Q00977 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gjb2Q00977 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gjb2Q00977 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gjb2Q00977 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gjb2Q00977 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gjb2Q00977 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gjb2Q00977 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gjb2Q00977 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gjb2Q00977 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gjb2Q00977 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gjb2Q00977 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gjb2Q00977 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gjb2Q00977 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gjb2Q00977 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gjb2Q00977 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gjb2Q00977 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gjb2Q00977 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gjb2Q00977 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gjb2Q00977 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gjb2Q00977 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gjb2Q00977 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gjb2Q00977 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Gjb2Q00977 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gjb2Q00977 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Gjb2Q00977 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gjb2Q00977 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gjb2Q00977 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gjb2Q00977 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gjb2Q00977 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gjb2Q00977 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Gjb2Q00977 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gjb2Q00977 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gjb2Q00977 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gjb2Q00977 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gjb2Q00977 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gjb2Q00977 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gjb2Q00977 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gjb2Q00977 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms