Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VegfaQ00731 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VegfaQ00731 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VegfaQ00731 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VegfaQ00731 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VegfaQ00731 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VegfaQ00731 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VegfaQ00731 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VegfaQ00731 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VegfaQ00731 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VegfaQ00731 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VegfaQ00731 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VegfaQ00731 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VegfaQ00731 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VegfaQ00731 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VegfaQ00731 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VegfaQ00731 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VegfaQ00731 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VegfaQ00731 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VegfaQ00731 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VegfaQ00731 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VegfaQ00731 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VegfaQ00731 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VegfaQ00731 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VegfaQ00731 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VegfaQ00731 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VegfaQ00731 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VegfaQ00731 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VegfaQ00731 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VegfaQ00731 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VegfaQ00731 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VegfaQ00731 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VegfaQ00731 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VegfaQ00731 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VegfaQ00731 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VegfaQ00731 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VegfaQ00731 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VegfaQ00731 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VegfaQ00731 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VegfaQ00731 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VegfaQ00731 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VegfaQ00731 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VegfaQ00731 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VegfaQ00731 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VegfaQ00731 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VegfaQ00731 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VegfaQ00731 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VegfaQ00731 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VegfaQ00731 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VegfaQ00731 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VegfaQ00731 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VegfaQ00731 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VegfaQ00731 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VegfaQ00731 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VegfaQ00731 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VegfaQ00731 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VegfaQ00731 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VegfaQ00731 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VegfaQ00731 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VegfaQ00731 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VegfaQ00731 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VegfaQ00731 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VegfaQ00731 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VegfaQ00731 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VegfaQ00731 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VegfaQ00731 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VegfaQ00731 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VegfaQ00731 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VegfaQ00731 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VegfaQ00731 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VegfaQ00731 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VegfaQ00731 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VegfaQ00731 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VegfaQ00731 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VegfaQ00731 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VegfaQ00731 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VegfaQ00731 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VegfaQ00731 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VegfaQ00731 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VegfaQ00731 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VegfaQ00731 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VegfaQ00731 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VegfaQ00731 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VegfaQ00731 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VegfaQ00731 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VegfaQ00731 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VegfaQ00731 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VegfaQ00731 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VegfaQ00731 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VegfaQ00731 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VegfaQ00731 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VegfaQ00731 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VegfaQ00731 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VegfaQ00731 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VegfaQ00731 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VegfaQ00731 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VegfaQ00731 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VegfaQ00731 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VegfaQ00731 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VegfaQ00731 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms