Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gabpb1Q00420 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gabpb1Q00420 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms