Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pou1f1Q00286 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Pou1f1Q00286 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pou1f1Q00286 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pou1f1Q00286 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pou1f1Q00286 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou1f1Q00286 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou1f1Q00286 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou1f1Q00286 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou1f1Q00286 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou1f1Q00286 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou1f1Q00286 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou1f1Q00286 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou1f1Q00286 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou1f1Q00286 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou1f1Q00286 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou1f1Q00286 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou1f1Q00286 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou1f1Q00286 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou1f1Q00286 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou1f1Q00286 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou1f1Q00286 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou1f1Q00286 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou1f1Q00286 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou1f1Q00286 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou1f1Q00286 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou1f1Q00286 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou1f1Q00286 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou1f1Q00286 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou1f1Q00286 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou1f1Q00286 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou1f1Q00286 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou1f1Q00286 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou1f1Q00286 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou1f1Q00286 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou1f1Q00286 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou1f1Q00286 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou1f1Q00286 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou1f1Q00286 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou1f1Q00286 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou1f1Q00286 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou1f1Q00286 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou1f1Q00286 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou1f1Q00286 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou1f1Q00286 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou1f1Q00286 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou1f1Q00286 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms