Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psmb4P99026 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psmb4P99026 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmb4P99026 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmb4P99026 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmb4P99026 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmb4P99026 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psmb4P99026 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psmb4P99026 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Psmb4P99026 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psmb4P99026 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psmb4P99026 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psmb4P99026 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psmb4P99026 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psmb4P99026 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Psmb4P99026 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Psmb4P99026 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Psmb4P99026 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmb4P99026 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmb4P99026 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmb4P99026 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmb4P99026 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmb4P99026 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmb4P99026 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmb4P99026 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmb4P99026 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmb4P99026 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmb4P99026 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmb4P99026 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmb4P99026 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmb4P99026 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmb4P99026 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmb4P99026 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmb4P99026 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmb4P99026 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmb4P99026 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmb4P99026 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmb4P99026 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmb4P99026 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Psmb4P99026 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psmb4P99026 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmb4P99026 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmb4P99026 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmb4P99026 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psmb4P99026 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psmb4P99026 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psmb4P99026 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psmb4P99026 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psmb4P99026 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psmb4P99026 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Psmb4P99026 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psmb4P99026 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Psmb4P99026 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Psmb4P99026 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psmb4P99026 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psmb4P99026 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psmb4P99026 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psmb4P99026 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psmb4P99026 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psmb4P99026 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psmb4P99026 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psmb4P99026 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psmb4P99026 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psmb4P99026 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psmb4P99026 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psmb4P99026 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psmb4P99026 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psmb4P99026 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psmb4P99026 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psmb4P99026 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psmb4P99026 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psmb4P99026 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psmb4P99026 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psmb4P99026 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psmb4P99026 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Psmb4P99026 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psmb4P99026 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psmb4P99026 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psmb4P99026 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psmb4P99026 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psmb4P99026 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psmb4P99026 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psmb4P99026 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmb4P99026 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmb4P99026 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmb4P99026 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmb4P99026 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmb4P99026 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmb4P99026 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmb4P99026 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmb4P99026 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmb4P99026 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psmb4P99026 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Psmb4P99026 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psmb4P99026 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psmb4P99026 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psmb4P99026 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmb4P99026 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmb4P99026 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmb4P99026 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms