Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smarcc1P97496 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Smarcc1P97496 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarcc1P97496 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarcc1P97496 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarcc1P97496 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarcc1P97496 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarcc1P97496 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarcc1P97496 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarcc1P97496 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarcc1P97496 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarcc1P97496 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarcc1P97496 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smarcc1P97496 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smarcc1P97496 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smarcc1P97496 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smarcc1P97496 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smarcc1P97496 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smarcc1P97496 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Smarcc1P97496 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Smarcc1P97496 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Smarcc1P97496 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Smarcc1P97496 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Smarcc1P97496 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Smarcc1P97496 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Smarcc1P97496 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Smarcc1P97496 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smarcc1P97496 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smarcc1P97496 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smarcc1P97496 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smarcc1P97496 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smarcc1P97496 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smarcc1P97496 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smarcc1P97496 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smarcc1P97496 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smarcc1P97496 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Smarcc1P97496 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarcc1P97496 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarcc1P97496 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarcc1P97496 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarcc1P97496 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smarcc1P97496 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smarcc1P97496 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Smarcc1P97496 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smarcc1P97496 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smarcc1P97496 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smarcc1P97496 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smarcc1P97496 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smarcc1P97496 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smarcc1P97496 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smarcc1P97496 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smarcc1P97496 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smarcc1P97496 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smarcc1P97496 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smarcc1P97496 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smarcc1P97496 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smarcc1P97496 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarcc1P97496 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarcc1P97496 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarcc1P97496 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarcc1P97496 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarcc1P97496 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarcc1P97496 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarcc1P97496 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarcc1P97496 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarcc1P97496 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarcc1P97496 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarcc1P97496 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarcc1P97496 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarcc1P97496 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarcc1P97496 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarcc1P97496 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarcc1P97496 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarcc1P97496 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarcc1P97496 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarcc1P97496 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarcc1P97496 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Smarcc1P97496 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Smarcc1P97496 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Smarcc1P97496 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Smarcc1P97496 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Smarcc1P97496 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarcc1P97496 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarcc1P97496 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarcc1P97496 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarcc1P97496 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarcc1P97496 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarcc1P97496 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarcc1P97496 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smarcc1P97496 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smarcc1P97496 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Smarcc1P97496 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smarcc1P97496 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smarcc1P97496 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smarcc1P97496 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarcc1P97496 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarcc1P97496 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarcc1P97496 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarcc1P97496 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarcc1P97496 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms