Protein–RNA interactions for Protein: P97471

Smad4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad4P97471 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smad4P97471 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smad4P97471 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smad4P97471 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smad4P97471 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smad4P97471 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Smad4P97471 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smad4P97471 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smad4P97471 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smad4P97471 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Smad4P97471 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smad4P97471 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smad4P97471 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smad4P97471 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smad4P97471 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smad4P97471 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smad4P97471 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smad4P97471 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Smad4P97471 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smad4P97471 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Smad4P97471 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smad4P97471 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smad4P97471 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smad4P97471 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smad4P97471 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smad4P97471 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Smad4P97471 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smad4P97471 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smad4P97471 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Smad4P97471 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smad4P97471 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smad4P97471 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smad4P97471 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smad4P97471 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smad4P97471 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smad4P97471 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smad4P97471 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smad4P97471 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smad4P97471 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smad4P97471 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smad4P97471 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smad4P97471 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smad4P97471 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Smad4P97471 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smad4P97471 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smad4P97471 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smad4P97471 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smad4P97471 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smad4P97471 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smad4P97471 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smad4P97471 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Smad4P97471 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smad4P97471 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smad4P97471 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smad4P97471 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smad4P97471 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smad4P97471 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smad4P97471 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smad4P97471 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smad4P97471 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smad4P97471 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Smad4P97471 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Smad4P97471 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smad4P97471 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smad4P97471 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Smad4P97471 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smad4P97471 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smad4P97471 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smad4P97471 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smad4P97471 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Smad4P97471 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smad4P97471 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smad4P97471 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smad4P97471 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smad4P97471 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smad4P97471 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smad4P97471 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smad4P97471 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smad4P97471 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smad4P97471 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smad4P97471 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Smad4P97471 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smad4P97471 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smad4P97471 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smad4P97471 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smad4P97471 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smad4P97471 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smad4P97471 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smad4P97471 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smad4P97471 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smad4P97471 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smad4P97471 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smad4P97471 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smad4P97471 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smad4P97471 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Smad4P97471 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Smad4P97471 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smad4P97471 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smad4P97471 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smad4P97471 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms