Protein–RNA interactions for Protein: P97412

Lyst, Lysosomal-trafficking regulator, mousemouse

Predictions only

Length 3,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LystP97412 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LystP97412 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LystP97412 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LystP97412 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LystP97412 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LystP97412 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LystP97412 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LystP97412 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LystP97412 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LystP97412 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LystP97412 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LystP97412 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LystP97412 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LystP97412 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LystP97412 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LystP97412 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LystP97412 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LystP97412 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LystP97412 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LystP97412 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LystP97412 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LystP97412 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LystP97412 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LystP97412 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LystP97412 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LystP97412 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LystP97412 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LystP97412 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LystP97412 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LystP97412 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LystP97412 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LystP97412 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LystP97412 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LystP97412 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LystP97412 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LystP97412 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LystP97412 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LystP97412 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LystP97412 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LystP97412 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LystP97412 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LystP97412 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LystP97412 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LystP97412 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LystP97412 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LystP97412 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LystP97412 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LystP97412 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LystP97412 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LystP97412 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LystP97412 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LystP97412 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LystP97412 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LystP97412 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LystP97412 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LystP97412 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LystP97412 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LystP97412 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LystP97412 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LystP97412 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LystP97412 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LystP97412 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LystP97412 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LystP97412 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LystP97412 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LystP97412 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LystP97412 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LystP97412 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LystP97412 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LystP97412 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LystP97412 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LystP97412 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LystP97412 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LystP97412 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LystP97412 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LystP97412 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LystP97412 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LystP97412 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LystP97412 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LystP97412 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LystP97412 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LystP97412 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LystP97412 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LystP97412 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LystP97412 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LystP97412 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LystP97412 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LystP97412 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LystP97412 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LystP97412 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LystP97412 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LystP97412 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LystP97412 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LystP97412 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LystP97412 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LystP97412 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LystP97412 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LystP97412 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LystP97412 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LystP97412 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms