Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SmsP97355 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SmsP97355 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SmsP97355 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SmsP97355 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SmsP97355 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SmsP97355 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SmsP97355 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SmsP97355 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SmsP97355 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SmsP97355 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SmsP97355 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SmsP97355 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SmsP97355 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SmsP97355 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SmsP97355 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SmsP97355 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SmsP97355 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SmsP97355 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SmsP97355 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SmsP97355 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SmsP97355 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SmsP97355 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SmsP97355 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SmsP97355 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SmsP97355 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SmsP97355 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SmsP97355 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SmsP97355 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SmsP97355 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SmsP97355 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SmsP97355 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SmsP97355 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SmsP97355 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SmsP97355 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SmsP97355 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SmsP97355 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SmsP97355 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SmsP97355 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SmsP97355 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SmsP97355 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SmsP97355 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SmsP97355 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SmsP97355 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SmsP97355 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SmsP97355 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SmsP97355 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SmsP97355 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SmsP97355 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SmsP97355 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SmsP97355 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SmsP97355 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SmsP97355 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SmsP97355 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SmsP97355 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SmsP97355 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SmsP97355 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SmsP97355 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SmsP97355 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SmsP97355 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SmsP97355 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SmsP97355 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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SmsP97355 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SmsP97355 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SmsP97355 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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SmsP97355 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SmsP97355 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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SmsP97355 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SmsP97355 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SmsP97355 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SmsP97355 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SmsP97355 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SmsP97355 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SmsP97355 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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SmsP97355 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SmsP97355 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SmsP97355 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SmsP97355 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SmsP97355 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SmsP97355 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SmsP97355 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SmsP97355 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SmsP97355 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SmsP97355 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SmsP97355 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SmsP97355 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SmsP97355 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SmsP97355 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SmsP97355 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SmsP97355 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SmsP97355 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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