Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nkx2-3P97334 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nkx2-3P97334 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nkx2-3P97334 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nkx2-3P97334 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Nkx2-3P97334 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nkx2-3P97334 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nkx2-3P97334 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nkx2-3P97334 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nkx2-3P97334 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nkx2-3P97334 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nkx2-3P97334 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nkx2-3P97334 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nkx2-3P97334 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nkx2-3P97334 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nkx2-3P97334 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nkx2-3P97334 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nkx2-3P97334 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Nkx2-3P97334 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nkx2-3P97334 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nkx2-3P97334 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nkx2-3P97334 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Nkx2-3P97334 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nkx2-3P97334 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nkx2-3P97334 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nkx2-3P97334 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nkx2-3P97334 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nkx2-3P97334 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nkx2-3P97334 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nkx2-3P97334 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Nkx2-3P97334 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nkx2-3P97334 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nkx2-3P97334 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Nkx2-3P97334 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nkx2-3P97334 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nkx2-3P97334 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nkx2-3P97334 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nkx2-3P97334 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nkx2-3P97334 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Nkx2-3P97334 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nkx2-3P97334 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nkx2-3P97334 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nkx2-3P97334 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nkx2-3P97334 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nkx2-3P97334 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nkx2-3P97334 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Nkx2-3P97334 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nkx2-3P97334 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nkx2-3P97334 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nkx2-3P97334 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nkx2-3P97334 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nkx2-3P97334 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nkx2-3P97334 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Nkx2-3P97334 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nkx2-3P97334 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nkx2-3P97334 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nkx2-3P97334 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Nkx2-3P97334 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nkx2-3P97334 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Nkx2-3P97334 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nkx2-3P97334 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Nkx2-3P97334 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nkx2-3P97334 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nkx2-3P97334 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nkx2-3P97334 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nkx2-3P97334 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nkx2-3P97334 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nkx2-3P97334 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nkx2-3P97334 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Nkx2-3P97334 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nkx2-3P97334 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nkx2-3P97334 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nkx2-3P97334 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nkx2-3P97334 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nkx2-3P97334 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nkx2-3P97334 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nkx2-3P97334 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nkx2-3P97334 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nkx2-3P97334 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nkx2-3P97334 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nkx2-3P97334 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nkx2-3P97334 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Nkx2-3P97334 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nkx2-3P97334 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nkx2-3P97334 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nkx2-3P97334 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nkx2-3P97334 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nkx2-3P97334 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nkx2-3P97334 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nkx2-3P97334 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nkx2-3P97334 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nkx2-3P97334 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nkx2-3P97334 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nkx2-3P97334 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nkx2-3P97334 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nkx2-3P97334 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nkx2-3P97334 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nkx2-3P97334 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nkx2-3P97334 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nkx2-3P97334 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms