Protein–RNA interactions for Protein: P97313

Prkdc, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 4,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkdcP97313 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkdcP97313 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkdcP97313 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkdcP97313 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkdcP97313 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkdcP97313 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkdcP97313 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkdcP97313 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkdcP97313 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkdcP97313 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkdcP97313 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkdcP97313 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkdcP97313 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkdcP97313 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkdcP97313 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkdcP97313 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkdcP97313 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkdcP97313 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkdcP97313 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkdcP97313 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkdcP97313 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkdcP97313 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkdcP97313 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkdcP97313 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkdcP97313 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkdcP97313 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkdcP97313 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkdcP97313 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkdcP97313 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkdcP97313 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkdcP97313 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkdcP97313 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkdcP97313 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkdcP97313 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkdcP97313 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkdcP97313 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkdcP97313 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkdcP97313 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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