Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Mesp1P97309 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mesp1P97309 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms