Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SeboxP70368 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SeboxP70368 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SeboxP70368 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SeboxP70368 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SeboxP70368 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SeboxP70368 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SeboxP70368 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SeboxP70368 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SeboxP70368 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SeboxP70368 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SeboxP70368 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SeboxP70368 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SeboxP70368 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SeboxP70368 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SeboxP70368 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SeboxP70368 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SeboxP70368 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SeboxP70368 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SeboxP70368 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SeboxP70368 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SeboxP70368 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SeboxP70368 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SeboxP70368 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SeboxP70368 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SeboxP70368 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SeboxP70368 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SeboxP70368 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SeboxP70368 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SeboxP70368 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SeboxP70368 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SeboxP70368 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms