Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ufd1P70362 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ufd1P70362 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ufd1P70362 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ufd1P70362 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ufd1P70362 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ufd1P70362 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ufd1P70362 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ufd1P70362 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ufd1P70362 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ufd1P70362 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ufd1P70362 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ufd1P70362 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ufd1P70362 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ufd1P70362 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ufd1P70362 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ufd1P70362 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ufd1P70362 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ufd1P70362 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ufd1P70362 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ufd1P70362 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ufd1P70362 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ufd1P70362 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ufd1P70362 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ufd1P70362 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ufd1P70362 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ufd1P70362 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ufd1P70362 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ufd1P70362 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ufd1P70362 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ufd1P70362 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ufd1P70362 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ufd1P70362 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ufd1P70362 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ufd1P70362 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ufd1P70362 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ufd1P70362 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ufd1P70362 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ufd1P70362 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms