Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msx3P70354 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Msx3P70354 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msx3P70354 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msx3P70354 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msx3P70354 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msx3P70354 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msx3P70354 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msx3P70354 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msx3P70354 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msx3P70354 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msx3P70354 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msx3P70354 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msx3P70354 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msx3P70354 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msx3P70354 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msx3P70354 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msx3P70354 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msx3P70354 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msx3P70354 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msx3P70354 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msx3P70354 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msx3P70354 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msx3P70354 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msx3P70354 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msx3P70354 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msx3P70354 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msx3P70354 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msx3P70354 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Msx3P70354 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msx3P70354 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msx3P70354 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msx3P70354 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msx3P70354 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msx3P70354 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msx3P70354 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msx3P70354 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msx3P70354 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msx3P70354 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msx3P70354 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msx3P70354 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msx3P70354 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msx3P70354 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Msx3P70354 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Msx3P70354 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msx3P70354 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msx3P70354 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msx3P70354 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msx3P70354 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msx3P70354 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msx3P70354 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msx3P70354 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msx3P70354 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msx3P70354 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msx3P70354 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msx3P70354 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msx3P70354 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msx3P70354 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msx3P70354 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msx3P70354 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msx3P70354 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Msx3P70354 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msx3P70354 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msx3P70354 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msx3P70354 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msx3P70354 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms