Protein–RNA interactions for Protein: P70343

Casp4, Caspase-4, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp4P70343 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casp4P70343 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casp4P70343 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casp4P70343 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casp4P70343 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casp4P70343 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Casp4P70343 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casp4P70343 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casp4P70343 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Casp4P70343 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casp4P70343 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casp4P70343 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casp4P70343 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casp4P70343 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casp4P70343 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casp4P70343 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casp4P70343 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casp4P70343 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casp4P70343 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casp4P70343 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casp4P70343 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casp4P70343 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casp4P70343 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casp4P70343 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casp4P70343 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casp4P70343 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casp4P70343 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casp4P70343 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Casp4P70343 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp4P70343 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp4P70343 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp4P70343 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp4P70343 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp4P70343 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp4P70343 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp4P70343 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp4P70343 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casp4P70343 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casp4P70343 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casp4P70343 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casp4P70343 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Casp4P70343 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casp4P70343 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casp4P70343 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casp4P70343 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casp4P70343 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casp4P70343 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casp4P70343 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Casp4P70343 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Casp4P70343 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casp4P70343 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casp4P70343 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casp4P70343 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casp4P70343 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casp4P70343 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casp4P70343 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casp4P70343 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casp4P70343 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casp4P70343 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casp4P70343 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casp4P70343 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casp4P70343 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casp4P70343 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casp4P70343 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casp4P70343 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casp4P70343 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casp4P70343 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp4P70343 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp4P70343 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp4P70343 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp4P70343 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp4P70343 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp4P70343 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp4P70343 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp4P70343 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp4P70343 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp4P70343 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp4P70343 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp4P70343 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp4P70343 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp4P70343 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp4P70343 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp4P70343 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp4P70343 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casp4P70343 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casp4P70343 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casp4P70343 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casp4P70343 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casp4P70343 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casp4P70343 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Casp4P70343 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casp4P70343 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casp4P70343 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casp4P70343 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casp4P70343 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casp4P70343 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casp4P70343 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casp4P70343 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casp4P70343 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casp4P70343 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms