Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Plxna3P70208 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Plxna3P70208 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Plxna3P70208 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Plxna3P70208 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Plxna3P70208 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Plxna3P70208 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Plxna3P70208 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Plxna3P70208 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Plxna3P70208 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Plxna3P70208 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Plxna3P70208 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Plxna3P70208 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Plxna3P70208 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Plxna3P70208 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Plxna3P70208 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Plxna3P70208 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Plxna3P70208 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plxna3P70208 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plxna3P70208 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plxna3P70208 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plxna3P70208 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Plxna3P70208 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Plxna3P70208 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Plxna3P70208 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Plxna3P70208 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Plxna3P70208 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Plxna3P70208 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Plxna3P70208 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Plxna3P70208 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms