Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Traf6P70196 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Traf6P70196 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Traf6P70196 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Traf6P70196 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Traf6P70196 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Traf6P70196 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf6P70196 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf6P70196 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf6P70196 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf6P70196 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf6P70196 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf6P70196 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf6P70196 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf6P70196 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf6P70196 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf6P70196 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf6P70196 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf6P70196 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf6P70196 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf6P70196 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf6P70196 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf6P70196 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf6P70196 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf6P70196 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Traf6P70196 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Traf6P70196 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf6P70196 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf6P70196 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf6P70196 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf6P70196 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf6P70196 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf6P70196 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf6P70196 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf6P70196 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf6P70196 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf6P70196 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf6P70196 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf6P70196 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf6P70196 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Traf6P70196 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Traf6P70196 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Traf6P70196 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Traf6P70196 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf6P70196 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Traf6P70196 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Traf6P70196 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Traf6P70196 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf6P70196 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf6P70196 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf6P70196 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Traf6P70196 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms