Protein–RNA interactions for Protein: P63163

Snrpn, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpnP63163 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnrpnP63163 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnrpnP63163 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnrpnP63163 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnrpnP63163 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SnrpnP63163 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnrpnP63163 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnrpnP63163 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnrpnP63163 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnrpnP63163 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnrpnP63163 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnrpnP63163 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnrpnP63163 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SnrpnP63163 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnrpnP63163 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnrpnP63163 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnrpnP63163 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnrpnP63163 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnrpnP63163 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnrpnP63163 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnrpnP63163 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnrpnP63163 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnrpnP63163 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnrpnP63163 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SnrpnP63163 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SnrpnP63163 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SnrpnP63163 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SnrpnP63163 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SnrpnP63163 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SnrpnP63163 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SnrpnP63163 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SnrpnP63163 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SnrpnP63163 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SnrpnP63163 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SnrpnP63163 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SnrpnP63163 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SnrpnP63163 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SnrpnP63163 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SnrpnP63163 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms