Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp2P63044 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp2P63044 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp2P63044 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp2P63044 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp2P63044 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vamp2P63044 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp2P63044 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp2P63044 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp2P63044 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp2P63044 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp2P63044 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp2P63044 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp2P63044 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp2P63044 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp2P63044 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp2P63044 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp2P63044 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp2P63044 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp2P63044 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp2P63044 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp2P63044 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp2P63044 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp2P63044 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp2P63044 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp2P63044 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp2P63044 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp2P63044 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp2P63044 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp2P63044 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp2P63044 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp2P63044 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp2P63044 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp2P63044 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp2P63044 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp2P63044 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp2P63044 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp2P63044 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp2P63044 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp2P63044 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp2P63044 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms