Protein–RNA interactions for Protein: P62956

Cacng7, Voltage-dependent calcium channel gamma-7 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng7P62956 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng7P62956 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng7P62956 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng7P62956 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng7P62956 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng7P62956 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacng7P62956 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacng7P62956 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacng7P62956 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacng7P62956 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng7P62956 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng7P62956 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng7P62956 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng7P62956 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng7P62956 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng7P62956 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng7P62956 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng7P62956 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng7P62956 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng7P62956 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng7P62956 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng7P62956 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng7P62956 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng7P62956 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng7P62956 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng7P62956 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng7P62956 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng7P62956 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng7P62956 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng7P62956 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng7P62956 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacng7P62956 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacng7P62956 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng7P62956 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms