Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl23P62830 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl23P62830 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl23P62830 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl23P62830 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl23P62830 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl23P62830 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl23P62830 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl23P62830 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl23P62830 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl23P62830 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl23P62830 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl23P62830 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl23P62830 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl23P62830 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl23P62830 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl23P62830 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl23P62830 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl23P62830 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl23P62830 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl23P62830 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl23P62830 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl23P62830 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl23P62830 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl23P62830 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl23P62830 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl23P62830 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl23P62830 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl23P62830 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl23P62830 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl23P62830 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl23P62830 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl23P62830 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl23P62830 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl23P62830 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl23P62830 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl23P62830 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl23P62830 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl23P62830 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl23P62830 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl23P62830 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl23P62830 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms