Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lsm5P62322 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lsm5P62322 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm5P62322 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms