Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snrpd1P62315 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snrpd1P62315 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snrpd1P62315 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snrpd1P62315 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snrpd1P62315 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snrpd1P62315 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snrpd1P62315 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snrpd1P62315 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snrpd1P62315 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snrpd1P62315 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snrpd1P62315 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snrpd1P62315 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snrpd1P62315 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Snrpd1P62315 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snrpd1P62315 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snrpd1P62315 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snrpd1P62315 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snrpd1P62315 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snrpd1P62315 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Snrpd1P62315 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snrpd1P62315 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snrpd1P62315 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snrpd1P62315 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snrpd1P62315 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Snrpd1P62315 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snrpd1P62315 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snrpd1P62315 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snrpd1P62315 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snrpd1P62315 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snrpd1P62315 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snrpd1P62315 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snrpd1P62315 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snrpd1P62315 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snrpd1P62315 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snrpd1P62315 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrpd1P62315 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrpd1P62315 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrpd1P62315 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrpd1P62315 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrpd1P62315 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrpd1P62315 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snrpd1P62315 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snrpd1P62315 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snrpd1P62315 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Snrpd1P62315 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snrpd1P62315 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snrpd1P62315 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snrpd1P62315 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snrpd1P62315 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snrpd1P62315 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snrpd1P62315 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snrpd1P62315 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms