Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp46P62069 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp46P62069 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp46P62069 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp46P62069 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp46P62069 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp46P62069 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp46P62069 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp46P62069 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp46P62069 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp46P62069 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp46P62069 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp46P62069 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp46P62069 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp46P62069 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp46P62069 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp46P62069 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp46P62069 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp46P62069 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp46P62069 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp46P62069 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp46P62069 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp46P62069 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp46P62069 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp46P62069 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp46P62069 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp46P62069 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp46P62069 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp46P62069 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp46P62069 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp46P62069 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp46P62069 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp46P62069 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp46P62069 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp46P62069 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp46P62069 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp46P62069 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp46P62069 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp46P62069 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp46P62069 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp46P62069 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp46P62069 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp46P62069 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp46P62069 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp46P62069 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp46P62069 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp46P62069 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp46P62069 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp46P62069 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp46P62069 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp46P62069 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp46P62069 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp46P62069 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp46P62069 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp46P62069 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp46P62069 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp46P62069 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp46P62069 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp46P62069 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp46P62069 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp46P62069 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp46P62069 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp46P62069 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp46P62069 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp46P62069 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp46P62069 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp46P62069 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp46P62069 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp46P62069 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp46P62069 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp46P62069 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp46P62069 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp46P62069 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp46P62069 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp46P62069 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp46P62069 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp46P62069 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp46P62069 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp46P62069 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp46P62069 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp46P62069 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp46P62069 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp46P62069 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp46P62069 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp46P62069 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp46P62069 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp46P62069 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp46P62069 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp46P62069 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp46P62069 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp46P62069 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp46P62069 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp46P62069 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp46P62069 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp46P62069 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp46P62069 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp46P62069 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp46P62069 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp46P62069 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp46P62069 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.9 ms