Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vbp1P61759 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vbp1P61759 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vbp1P61759 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Vbp1P61759 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vbp1P61759 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vbp1P61759 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vbp1P61759 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vbp1P61759 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vbp1P61759 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vbp1P61759 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vbp1P61759 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vbp1P61759 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vbp1P61759 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vbp1P61759 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vbp1P61759 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vbp1P61759 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vbp1P61759 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vbp1P61759 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vbp1P61759 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vbp1P61759 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vbp1P61759 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vbp1P61759 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vbp1P61759 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vbp1P61759 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Vbp1P61759 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vbp1P61759 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vbp1P61759 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vbp1P61759 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vbp1P61759 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vbp1P61759 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vbp1P61759 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vbp1P61759 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vbp1P61759 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Vbp1P61759 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vbp1P61759 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vbp1P61759 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vbp1P61759 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vbp1P61759 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vbp1P61759 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vbp1P61759 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vbp1P61759 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vbp1P61759 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vbp1P61759 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vbp1P61759 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vbp1P61759 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vbp1P61759 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vbp1P61759 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.7
Vbp1P61759 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vbp1P61759 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vbp1P61759 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vbp1P61759 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vbp1P61759 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vbp1P61759 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vbp1P61759 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vbp1P61759 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms