Protein–RNA interactions for Protein: P61211

Arl1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl1P61211 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arl1P61211 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arl1P61211 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arl1P61211 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arl1P61211 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arl1P61211 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arl1P61211 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arl1P61211 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arl1P61211 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Arl1P61211 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Arl1P61211 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Arl1P61211 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arl1P61211 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Arl1P61211 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arl1P61211 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arl1P61211 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Arl1P61211 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arl1P61211 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Arl1P61211 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arl1P61211 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arl1P61211 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Arl1P61211 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arl1P61211 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Arl1P61211 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arl1P61211 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Arl1P61211 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arl1P61211 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arl1P61211 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arl1P61211 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arl1P61211 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Arl1P61211 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Arl1P61211 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Arl1P61211 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Arl1P61211 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Arl1P61211 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arl1P61211 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Arl1P61211 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arl1P61211 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arl1P61211 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arl1P61211 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Arl1P61211 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Arl1P61211 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Arl1P61211 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arl1P61211 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Arl1P61211 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arl1P61211 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arl1P61211 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arl1P61211 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arl1P61211 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arl1P61211 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arl1P61211 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Arl1P61211 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arl1P61211 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arl1P61211 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arl1P61211 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Arl1P61211 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arl1P61211 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arl1P61211 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arl1P61211 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arl1P61211 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arl1P61211 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arl1P61211 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Arl1P61211 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Arl1P61211 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arl1P61211 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arl1P61211 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arl1P61211 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arl1P61211 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arl1P61211 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arl1P61211 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arl1P61211 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arl1P61211 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arl1P61211 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arl1P61211 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arl1P61211 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arl1P61211 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arl1P61211 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arl1P61211 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arl1P61211 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arl1P61211 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arl1P61211 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Arl1P61211 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arl1P61211 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arl1P61211 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arl1P61211 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arl1P61211 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arl1P61211 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Arl1P61211 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arl1P61211 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arl1P61211 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arl1P61211 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arl1P61211 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arl1P61211 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arl1P61211 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Arl1P61211 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arl1P61211 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arl1P61211 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arl1P61211 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arl1P61211 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arl1P61211 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms