Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2kP61087 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2kP61087 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2kP61087 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2kP61087 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2kP61087 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2kP61087 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2kP61087 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2kP61087 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2kP61087 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2kP61087 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2kP61087 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2kP61087 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2kP61087 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2kP61087 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2kP61087 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2kP61087 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2kP61087 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2kP61087 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2kP61087 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2kP61087 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2kP61087 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2kP61087 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2kP61087 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2kP61087 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2kP61087 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2kP61087 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2kP61087 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2kP61087 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2kP61087 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2kP61087 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2kP61087 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2kP61087 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2kP61087 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2kP61087 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2kP61087 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2kP61087 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2kP61087 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2kP61087 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2kP61087 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2kP61087 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2kP61087 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2kP61087 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2kP61087 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2kP61087 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2kP61087 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2kP61087 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2kP61087 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2kP61087 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2kP61087 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2kP61087 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2kP61087 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2kP61087 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2kP61087 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2kP61087 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2kP61087 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2kP61087 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2kP61087 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2kP61087 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2kP61087 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2kP61087 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2kP61087 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2kP61087 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2kP61087 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2kP61087 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2kP61087 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2kP61087 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2kP61087 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2kP61087 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2kP61087 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2kP61087 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2kP61087 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2kP61087 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2kP61087 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2kP61087 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2kP61087 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2kP61087 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2kP61087 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2kP61087 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2kP61087 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2kP61087 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ube2kP61087 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ube2kP61087 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2kP61087 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 209.9 ms